SCI投稿是论文顺利发表的重要一步，如果在投稿过程中疏忽大意，就很可能导致论文发表的失败。所以，了解SCI投稿的整个过程是十分必要的。接下来，我们就来谈谈SCI投稿过程。
第一
首先决定投那份SCI刊物。作者一般在撰写论文时就已经做出决定。主要决策依据应是主题内容合适，学术声誉好，读者多等。当然也要看自己成果的大小，论文的质量而定。勿一稿两投。
在本领域内的、预期影响因子范围内的期刊中，从期刊名初步筛选可能合适自己文章内容的期刊。然后找到期刊的介绍，阅读其“目标和范围”(aimandscope)，以确定稿件是否符合。接下来再看看期刊近几年内影响因子的走势，以其保持上升或稳定为佳。
另外一个可以参考的指标是该期刊是否曾在过去发表过相当数量的中国作者的文章。学术期刊终归是商业杂志，出版商以赢利为最终目的。世界各地的期刊，可能因为这样那样的原因，有自己的偏好。
并不是说没有发表过中国作者文章的期刊就一定不能投稿，但是相较而言，在其它各方面差不多的情况下，曾经发表过大量中国作者文章的期刊一般会对中国作者更友好，期刊编辑也更熟悉和中国作者的交流方式。
还有一个需要考虑的因素是期刊的审稿周期(turnaroundtime)，指的是从期刊收到投稿到编辑发出第一封关于决定的回复的时间(接受，需修改，或者拒稿)。很多期刊会在网页介绍中列出审稿周期，这是给作者的一个参考，也是一种承诺。
一般来说，高水平杂志(high-profilejournals)的审稿周期比较短。决定文章是否被期刊采纳的最最主要的因素当然是文章的质量和意义，但是这其中有时也有些些儿运气在。
通俗的说，第一次投稿可以“碰碰运气，”就算失败，损失的不过是一个审稿周期的时间(比如两个星期到一个月)。而如果文章真入了审稿专家和编辑的法眼，能在高影响因子的期刊上发表，对作者可谓益处多多。当然，也要注意不同的期刊对文章的格式和字数方面的要求会有所差异。
一篇文章被一个期刊拒稿后原稿件不经过修改是不能直接投到另一个期刊的。但是，这种修改一般只是格式上的，不需要花费太多的时间(注：影响因子超高的几个期刊，比如nature和science，对篇幅的限制非常苛刻，要求文章短小精悍，所以如果被这种杂志拒稿，再投下一个目标期刊的时候往往需要对稿件进行扩充，补充之前被省略的细节或次要实验)。
第二
论文完成后，要按照每份刊物的投稿要求投稿。一般的投稿清单包括：投稿信、足够的稿件数、所有图表齐全、以及其它要求的材料。将上述内容打包邮寄，或通过电子网络按要求投递稿件。
第三
论文投出后，一般刊物编辑部会给投稿作者发送收到稿件通知。如果编辑觉得论文题材不适合所投刊物，会回信退稿。否则，作者就进入等待期。收到稿件后，编辑挑选2-3名同行对论文进行评审。论文评审是对作者采用匿名形式。评审者不是专职，是自愿花时间评阅论文(并无评审费)。
由于评阅人一般是已经在本领域建立了地位，比较忙，因此往往需要花较长时间。投稿者应对此予以理解。另外，由于评阅人较忙或其它原因，有的评审意见不一定贴切。是值得商榷的。编辑在审稿过程中是仲裁和最后决策者。审稿期间，作者一般应耐心等待。除按收稿通知建议时间与编辑联系外，一般应给评审4-6个月时间。若仍无消息，可以与编辑联系催促一下。
论文评审的分一般内容和专业内容两部分。一般评审内容包括：稿件是否适合所投刊物;若发表此文读者面会有多大;是否有现势性-即是否需要尽快发表;论文的理论、方法、和数据等是否有创新性;论文有无重大缺陷(理论、方法、实验结果等);论文结果是否重要(若设立奖励的刊物会征求是否建议奖励);论文可读性如何;长短是否合适-与论文重要性是否平衡;图表是否必须，质量如何;有没有忽略重要前人工作。
专业内容是评审者对论文中不正确或存有疑问的内容、表述方法、写作缺陷等提出批评。没有具体形式。
审稿结束，作者迟早会收到稿件评审意见和编辑的仲裁结果。
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